生物有机肥中含有大量有益微生物，能分化泥土中的有机质，增长泥土团圆体结构，改善泥土组成。微生物在泥土中成长得很快，就像一张看不见的网，盘根错节。微生物殒命后，泥土中会留下很多微管。

　　这些微管不仅增长了泥土的渗入性，并且使泥土蓬松柔软，营养和水分不易流失，增长了泥土的水肥贮存能力，预防和解除了泥土硬化。泥土中的有机质能改善泥土理化性质，使泥土更好地耕作，加强渗水能力。

　　提高泥土蓄水、保肥、供肥和抗旱防涝能力，增产显著，是化肥不成代替的。生物有机肥中的有益微生物还能够节造有害细菌的滋生，从而削减农药的使用。

　　若是陆续使用多年，可有效节造泥土中的有害生物，节俭劳动力和传染。有机肥中的微生物拥有很强的性命力，能在泥土中持久存活。固氮菌、溶磷菌、释钾菌能利用空气中的氮，开释泥土中不易被作物吸收的钾、磷，持续供给作物营养。